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岑特分享PCR缓冲液的相关介绍

阅读次数:374   发布时间:2022/12/27 11:27:01

  用于PCR的标准缓冲液见PCR操作范例。于72℃时,反应体系的pH值将下降1个单位,接近于7.2。二价阳离子的存在至关重要,影响PCR的特异性和产量。实验表明,Mg2 优于Mn2 ,而Ca2 无任何作用。
 

  1.Mg2 浓度Mg2 的佳浓度为1.5mmol/L(当各种dNTP浓度为200mmol/L时),但并非对任何一种模板与引物的结合都是佳的。次使用靶序列和引物结合时,都要把Mg2 浓度调到佳,其浓度变化范围为1~10mmol/L。Mg2 过量易生成非特异性扩增产物,Mg2 不足易使产量降低。

  样品中存在的较高浓度的螯合剂如EDTA或高浓度带负电荷的离子基团如磷酸根,会与Mg2 结合而降低Mg2 有效浓度。因此,用作模板的DNA应溶于10mmol/l Tris-HCl(pH7.6)0.1mmol/L EDTA中。

  dNTP含有磷酸根,其浓度变化将影响Mg2 的有效浓度。标准反应体系中4×dTNPs的总浓度为0.8mmol/L,低于1.5mmol/L的Mg2 浓度。因此,在高浓度DNA及dNTP条件时,必须相应调整Mg2 的浓度。

  2.Tris -HCl缓冲液在PCR中使用10~50mmol/L的Tris –HCl缓冲液,很少使用其他类型的缓冲液。Tris缓冲液是一种双化的离子缓冲液,pKa为8.3(20℃),△pKa为0.021/℃。因此,20mmol/l Tris pH8.3(20℃)时,在典型的热循环条件下,真正的pH值在7.8~6.8之间。

  3.KCl浓度K 浓度在50mmol/L 时能促进引物退火。但研究表明,NaCl浓度在50mmol/L时,KCl浓度高于50mmol/L将会抑制Taq酶的活性,少加或不加KCl对PCR结果没有太大影响。

  4.明胶明胶和BSA或非离子型去垢剂具有稳定酶的作用。一般用量为100μg/ml,但现在的研究表明,加或不加都能得到良好和PCR结果,影响不大。

  5.二甲基亚砜(DMSO)在使用Klenow片段进行PCR时DMSO是有用的;加入10%DM-SO有利于减少DNA的二结构,使(G C)%含量高的模板易于完全变性,在反应体系中加入DMSO使PCR产物直接测序更易进行,但超过10%时会抑制Taq DNA聚合酶的活性,因此,大多数并不使用DMSO。

  PCR中Ph缓冲液的作用

  ,PCR缓冲液就是给PCR反应提供的一个适酶催反应条件。

  第二,例如缓冲液中的镁离子在酶催化过程中,结合到酶-底物结合体上,从而使催化反应的活化能更加降低。使得反应能够进行。

  第三,PH缓冲液是保证PCR反应正常进行的关键条件。

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