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western blot试验中遇到的些问题~
阅读次数:544 发布时间:2021/3/16 10:55:07
western blot,这个不做个十次八次,基本出不来好看条带的实验,相信让很多小伙伴都感到头秃。下面古朵生物生物带小伙伴们了解下western blot试验中遇到的些问题~
做胶
Q. 注意事项
配缓冲液过程中,过硫-酸铵后加,防止出现过多气泡。
温度:温度越高凝固越快,胶通常在0.5-1h内凝固好。充分凝固后可保鲜膜包裹4℃过夜,第二天使用。
Q. 如何判断样品总蛋白的提取是否成功?
跑胶:蛋白浓度检测,浓度低可能是提取不成功。
转膜后:丽春红染色,正常的话可以看到很多蛋白条带。
显色后:内参及目的蛋白的检测。
上样
Q. 上样时有的样品沉淀,有的清亮?
1.考虑没有完全变性,适当提高SDS浓度,同时延长煮沸时间。
2.考虑蛋白浓度过高,加入缓冲液稀释。
电泳
Q. 影响电泳结果的因素
1. 电压:低电压下筛选效应充分,条带漂亮。
2. 胶的均匀度:胶越均匀,条带越窄,分离越均匀。
Q. 条带形状
︶笑脸型:凝结冷却不均匀,中间冷却不好。
︵皱眉状:可能凝胶和玻璃板底部有气泡。
拖尾:样品溶解不好
纵向条纹:样品中有不溶性颗粒
条带偏斜:电不平衡或者加样位置偏斜
条带两边扩散:加样量过多溢出
Q. 大分子量蛋白转移效率低?
转移缓冲液加SDS(终浓度0.1%);提高转移电压/电流;增加转移时间
Q. 小分子量蛋白转移需注意?
使用0.22um 或0.1um 的NC膜;减少转移时间,30min足够。
转膜
我们用的是湿转法,效率比较高,如果目的蛋白很小,可以考虑半干转。
Q. 过转和转膜不充分?
对于大分子量(>100kd)蛋白而言,般不用考虑过转情况,看条带对应的marker是否转上,即可确定自己的条带是否转上。如果没有,适当增加电压/电流,延长时间,还有避免胶和膜中间有气泡。
小分子量(<15kd)尤蛋白容易出现过转,同样丽春红染膜或观察marker即可确认有没有过转。
Q. PVDF的预处理?
PVDF膜先置于甲醇中处理10 s,然后浸于电转缓冲液中10 min,再夹三明治。NC膜则不需要预处理。
封闭
我们用的是5%脱脂奶粉,10%TBS缓冲液配制。
Q. 封闭时间
正常情况,室温封闭1h即可。如果曝光背景过高,可以适当延长封闭时间至2-5h,也可以4℃过夜,封闭时间过长并不会导致检测信号减弱。
如果延长了封闭时间,背景还是高。考虑抗体浓度过高,可稀释使用;目的蛋白丰度太低,信号弱。
Q. 封闭液有杂质颗粒?
(静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层)
牛奶里面会有些不悬浮的大颗粒,对封闭无益。可以在转膜开始之后配好牛奶,在充分搅拌好的提下,静置于4℃。使用时不要担心牛奶不均而特意混匀,只吸上层部分完全ok。
孵抗体
Q. 如何提高磷酸化抗体的检测质量?
提高蛋白上样量;适当增加封闭时间,延长抗孵育时间;封闭的选择:5%脱脂奶粉? 5%BSA?;磷酸酶抑制剂;样本低温操作,好是新鲜样品,反复冻融易降解。
显影
Q. 目的条带很弱?
加大上样量,调整抗体比例,转膜效率。
Q. 背景太深?
降低抗体比例;封闭液中加去垢剂:吐温20;降低上样量;用其他蛋白做封闭液:5%BSA,serum;
Q. 条带有时清晰,有时弥散?
样品可能存在降解;转膜不及时造成扩散。
做胶
Q. 注意事项
配缓冲液过程中,过硫-酸铵后加,防止出现过多气泡。
温度:温度越高凝固越快,胶通常在0.5-1h内凝固好。充分凝固后可保鲜膜包裹4℃过夜,第二天使用。
Q. 如何判断样品总蛋白的提取是否成功?
跑胶:蛋白浓度检测,浓度低可能是提取不成功。
转膜后:丽春红染色,正常的话可以看到很多蛋白条带。
显色后:内参及目的蛋白的检测。
上样
Q. 上样时有的样品沉淀,有的清亮?
1.考虑没有完全变性,适当提高SDS浓度,同时延长煮沸时间。
2.考虑蛋白浓度过高,加入缓冲液稀释。
电泳
Q. 影响电泳结果的因素
1. 电压:低电压下筛选效应充分,条带漂亮。
2. 胶的均匀度:胶越均匀,条带越窄,分离越均匀。
Q. 条带形状
︶笑脸型:凝结冷却不均匀,中间冷却不好。
︵皱眉状:可能凝胶和玻璃板底部有气泡。
拖尾:样品溶解不好
纵向条纹:样品中有不溶性颗粒
条带偏斜:电不平衡或者加样位置偏斜
条带两边扩散:加样量过多溢出
Q. 大分子量蛋白转移效率低?
转移缓冲液加SDS(终浓度0.1%);提高转移电压/电流;增加转移时间
Q. 小分子量蛋白转移需注意?
使用0.22um 或0.1um 的NC膜;减少转移时间,30min足够。
转膜
我们用的是湿转法,效率比较高,如果目的蛋白很小,可以考虑半干转。
Q. 过转和转膜不充分?
对于大分子量(>100kd)蛋白而言,般不用考虑过转情况,看条带对应的marker是否转上,即可确定自己的条带是否转上。如果没有,适当增加电压/电流,延长时间,还有避免胶和膜中间有气泡。
小分子量(<15kd)尤蛋白容易出现过转,同样丽春红染膜或观察marker即可确认有没有过转。
Q. PVDF的预处理?
PVDF膜先置于甲醇中处理10 s,然后浸于电转缓冲液中10 min,再夹三明治。NC膜则不需要预处理。
封闭
我们用的是5%脱脂奶粉,10%TBS缓冲液配制。
Q. 封闭时间
正常情况,室温封闭1h即可。如果曝光背景过高,可以适当延长封闭时间至2-5h,也可以4℃过夜,封闭时间过长并不会导致检测信号减弱。
如果延长了封闭时间,背景还是高。考虑抗体浓度过高,可稀释使用;目的蛋白丰度太低,信号弱。
Q. 封闭液有杂质颗粒?
(静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层)
牛奶里面会有些不悬浮的大颗粒,对封闭无益。可以在转膜开始之后配好牛奶,在充分搅拌好的提下,静置于4℃。使用时不要担心牛奶不均而特意混匀,只吸上层部分完全ok。
孵抗体
Q. 如何提高磷酸化抗体的检测质量?
提高蛋白上样量;适当增加封闭时间,延长抗孵育时间;封闭的选择:5%脱脂奶粉? 5%BSA?;磷酸酶抑制剂;样本低温操作,好是新鲜样品,反复冻融易降解。
显影
Q. 目的条带很弱?
加大上样量,调整抗体比例,转膜效率。
Q. 背景太深?
降低抗体比例;封闭液中加去垢剂:吐温20;降低上样量;用其他蛋白做封闭液:5%BSA,serum;
Q. 条带有时清晰,有时弥散?
样品可能存在降解;转膜不及时造成扩散。
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