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慢病毒感染后荧光表达较弱的原因

点击次数:282   发布时间:2023/2/6 9:50:32

 荧光蛋白的亮度与启动子、表达方式和连接原件等有关,不同启动子诱导荧光蛋白表达的强弱不同,如UBC相对于EF1α、CAG、CMV等强启动子表达较弱。

融合或非融合表达与荧光强度也有很大关系,融合表达时荧光蛋白可能出现错误折叠等现象,导致检测不到荧光信号或荧光较弱。非融合表达时一般选择连接肽作为连接原件,如2A肽或IRES将ORF分隔开;选择IRES,下游ORF的表达明显弱于上游,2A肽可以避免上下游ORF表达强弱不一致的问题,因此更为常用,如P2A和T2A不过2A肽切割后容易有残留氨基酸。

带荧光的慢病毒感染细胞后,荧光的强度取决于病毒进入到细胞的颗粒数、细胞状态、细胞类型、观察时间等因素,荧光表达的强度与目的细胞感染病毒的颗粒数正相关,一般感染细胞后72h观察荧光强度/佳,而增殖较慢的细胞可以适当延长时间。

也可能会遇到过表达的慢病毒比对照的荧光要暗的情况,这主要是因为基因的插入,会影响位于下游的荧光蛋白表达,对照或干扰的病毒由于没有插入或插入序列非常短荧光不受影响,而插入基因后,尤其是较长片段和高GC片段,则会降低荧光强度。

荧光蛋白的亮度与启动子、表达方式和连接原件等有关,不同启动子诱导荧光蛋白表达的强弱不同,如UBC相对于EF1α、CAG、CMV等强启动子表达较弱。

 荧光蛋白的亮度与启动子、表达方式和连接原件等有关,不同启动子诱导荧光蛋白表达的强弱不同,如UBC相对于EF1α、CAG、CMV等强启动子表达较弱。

融合或非融合表达与荧光强度也有很大关系,融合表达时荧光蛋白可能出现错误折叠等现象,导致检测不到荧光信号或荧光较弱。非融合表达时一般选择连接肽作为连接原件,如2A肽或IRES将ORF分隔开;选择IRES,下游ORF的表达明显弱于上游,2A肽可以避免上下游ORF表达强弱不一致的问题,因此更为常用,如P2A和T2A不过2A肽切割后容易有残留氨基酸。

带荧光的慢病毒感染细胞后,荧光的强度取决于病毒进入到细胞的颗粒数、细胞状态、细胞类型、观察时间等因素,荧光表达的强度与目的细胞感染病毒的颗粒数正相关,一般感染细胞后72h观察荧光强度/佳,而增殖较慢的细胞可以适当延长时间。

也可能会遇到过表达的慢病毒比对照的荧光要暗的情况,这主要是因为基因的插入,会影响位于下游的荧光蛋白表达,对照或干扰的病毒由于没有插入或插入序列非常短荧光不受影响,而插入基因后,尤其是较长片段和高GC片段,则会降低荧光强度。

荧光蛋白的亮度与启动子、表达方式和连接原件等有关,不同启动子诱导荧光蛋白表达的强弱不同,如UBC相对于EF1α、CAG、CMV等强启动子表达较弱。

原创作者:上海岑特生物科技有限公司

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